毛穴の黒ずみの原因として毛穴に巣くう細菌やカビがあります。
毛穴の浅いところから肌の表面には、表皮ブドウ球菌(Staphylococcus epidermidis)が、
毛穴の深いところにはPropionibacterium acnes(俗に言うニキビ菌)がいます。
特にこのニキビ菌は脂漏部位(毛穴の黒ずみが起こりやすい場所)に多くいます。
また、Pityrosporum属(新しい分類ではMalassezia)と呼ばれる種類の真菌もいて、
これらはリパーゼで皮脂を分解して栄養としています。
さらに、ニキビダニ属という種類のダニが毛穴から脂腺の管にいて
壊れた細胞を栄養として生きています。
これらの細菌や真菌、ダニは、直接あるいは間接的に毛穴の黒ずみの原因となり得ます。